Vermutlich bist du auch wirklich schuld Im Spigot-Forum gibts Einen Eintrag über ein ähnliches Problem, ich würde mal vermuten, dass die dort genannte Lösung evtl. helfen würde:
https://www.spigotmc.org/threads/players-disconnecting-in-certain-chunks.70816/page-4

Kann natürlich auch was anderes sein, wäre jetzt aber mal meine Vermutung. Wobei es seltsam ist, da das anscheinend schon mit der 1.8.7 gefixt worden sein sollte.